Comment les médicaments affectent le microbiome intestinal

How Medication Affects the Gut Microbiome

Introduction

Le microbiome intestinal humain est constitué de milliards de bactéries et autres micro-organismes vivant en symbiose avec notre organisme. En tant que professionnels du bien-être, nous devons comprendre que le microbiome intestinal joue un rôle essentiel dans l'évolution de la santé des patients. De nombreux patients ont recours à divers médicaments pour soutenir leur santé immunitaire, digestive et mentale, mais les médicaments prescrits régulièrement peuvent perturber l'équilibre fragile du microbiome, entraînant des conséquences indésirables sur la santé. Trois de ces médicaments ont démontré un impact sur le microbiome intestinal : les inhibiteurs sélectifs de la recapture de la sérotonine (ISRS), les anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS) et les antibiotiques. Comprendre leur effet sur la santé intestinale est essentiel pour tirer le meilleur parti des médicaments dont tant de personnes dépendent.


Comment les ISRS affectent l'intestin

Il a été démontré que les ISRS modifient l'équilibre bactérien intestinal. La paroxétine et l'escitalopram réduisent souvent la prolifération de certains types de bactéries, comme les Firmicutes, tout en favorisant la croissance d'autres comme les Bacteroidetes et Eubacterium ramulus. Ces modifications ont des effets anti-inflammatoires démontrés chez les patients [2]. Cependant, dans certains cas, des bactéries réduisant la biodisponibilité des ISRS, comme Streptococcus salivarius, peuvent s'accumuler pendant le traitement par ISRS [4]. Par conséquent, des concentrations élevées de Streptococcus salivarius peuvent affecter l'efficacité du médicament en empêchant l'organisme de métaboliser et d'utiliser efficacement les ISRS.

Dans cette optique, il est important de comprendre la composition de son microbiote intestinal avant et pendant un traitement par ISRS, car cela peut influencer l'efficacité des médicaments contre la dépression. Les personnes présentant une concentration initiale élevée de certaines bactéries bénéfiques, comme Faecalibacterium et Roseburia, sont plus susceptibles de voir leur état s'améliorer avec les ISRS, tandis que celles présentant des concentrations élevées de microbes nocifs, comme Proteobacteria, ont tendance à moins bien réagir [4]. Comprendre le déséquilibre microbien intestinal propre à chaque personne pourrait permettre de déterminer le meilleur antidépresseur pour elle.

Cela signifie qu'une modification stratégique du microbiome intestinal pourrait améliorer l'efficacité des ISRS. Par exemple, des composés comme le butyrate de sodium, qui rétablissent l'équilibre microbien, peuvent réduire les effets secondaires et améliorer la réponse aux ISRS [4]. L'association de probiotiques comme Lactobacillus et Bifidobacterium avec des fibres dont ils se nourrissent, appelées symbiotiques, peut renforcer les effets positifs des ISRS [2]. Enfin, des modifications du régime alimentaire, des programmes nutritionnels personnalisés ou des cocktails de probiotiques spécifiques au patient, adaptés aux profils de dysbiose spécifiques de chaque patient, peuvent optimiser ces effets positifs des antidépresseurs médiés par le microbiome [4].

De plus en plus de données probantes montrent que la flore intestinale et les ISRS s'influencent mutuellement de manière significative, influençant ainsi l'efficacité des médicaments contre la dépression. La poursuite des recherches sur l'évolution à long terme du microbiome sous l'effet des ISRS pourrait contribuer à la personnalisation et à l'amélioration de la pharmacothérapie grâce à des produits ciblant le microbiome.


Les AINS et le microbiome

Plusieurs études menées chez l'animal et l'humain démontrent que l'administration d'AINS entraîne des modifications significatives de la composition et de la fonction du microbiote intestinal. Les AINS peuvent avoir des effets antibactériens directs, tout en modifiant l'environnement intestinal de manière à précipiter une dysbiose. Plus précisément, les AINS sont associés à une diminution de l'abondance des bactéries du phylum Firmicutes et à une augmentation des proportions des espèces Bacteroidetes et Proteobacteria [1]. Ces modifications favorisent les bactéries Gram-négatives et anaérobies impliquées dans l'inflammation et les lésions intestinales [1]. Non traitée, l'inflammation intestinale chronique peut entraîner des diarrhées, des douleurs abdominales et une perte de poids rapide, symptômes fréquemment observés chez les patients atteints de MICI et de la maladie de Crohn [7].

Il existe un chevauchement important entre les modifications microbiennes causées par les AINS et les dysbioses liées aux maladies traitées par ces médicaments, comme la spondylarthrite, la polyarthrite rhumatoïde et la douleur neuropathique diabétique. Par exemple, les AINS et les opioïdes augmentent tous deux la présence de Prevotella, dont la sévérité est corrélée positivement à la polyarthrite rhumatoïde [3]. Ainsi, l'utilisation prolongée de ces médicaments peut contribuer à la persistance de la maladie ou en limiter l'efficacité en favorisant les proliférations microbiennes responsables d'inflammations [1].

La relation entre les AINS et le microbiome est complexe. Il est donc important de comprendre les causes et les conséquences de la dysbiose médicamenteuse, ainsi que son rôle dans l'efficacité et la progression de la maladie, en particulier lorsqu'on envisage de prescrire des AINS.


Antibiotiques : l'épée à double tranchant du microbiome

Tout comme les ISRS et les AINS, des preuves substantielles montrent que les antibiotiques perturbent considérablement le microbiome intestinal, induisant une dysbiose [5]. Des études cliniques et animales démontrent des compositions microbiennes altérées après une exposition aux antibiotiques [5]. L'utilisation d'antibiotiques à court terme décime les populations de bactéries bénéfiques telles que Bifidobacterium et Lactobacillus. Simultanément, il a été démontré que des agents pathogènes comme Clostridium difficile et Salmonella se développent dans l'écosystème perturbé [6]. Les antibiotiques ont également un impact négatif sur la communication intestin-cerveau par de multiples mécanismes, notamment une production bactérienne réduite de neurotransmetteurs comme le GABA et la sérotonine, une expression diminuée du facteur neurotrophique dérivé du cerveau, une atteinte de la barrière hémato-encéphalique et une activation des voies inflammatoires [5]. Il est intéressant de noter que ces altérations persistent pendant des semaines, voire des années, après l'arrêt des antibiotiques [6], entraînant une dysbiose qui perturbe les contributions du microbiome au métabolisme, à l'immunité et à la résistance à la colonisation [6].

Outre les dommages écologiques, les antibiotiques favorisent la résistance aux antibiotiques par transfert horizontal de gènes entre bactéries intestinales [6]. Les souches et gènes résistants continuent de se propager à d'autres microbes même après l'élimination des antibiotiques. Cette expansion de la résistance aux antibiotiques menace de limiter les options thérapeutiques viables contre les infections à long terme. La dysbiose induite par les antibiotiques semble également réduire l'efficacité des médicaments dont l'activation ou le métabolisme dépend des enzymes bactériennes [6].

Des recherches complémentaires sont nécessaires pour identifier précisément les impacts des changements taxonomiques induits par les antibiotiques [5]. Par exemple, des analyses comparatives pourraient également déterminer quelles classes d'antibiotiques ont le plus d'impact sur les bactéries productrices de nutriments bénéfiques et de neurotransmetteurs. Mieux comprendre l'influence des antibiotiques sur la fonctionnalité microbienne et la physiologie de l'hôte est essentiel pour développer des thérapies ciblant le microbiome et atténuant les effets secondaires indésirables des antibiotiques.


Conclusion

De plus en plus de recherches révèlent les effets omniprésents des ISRS, des AINS et des antibiotiques, largement prescrits, sur la flore intestinale, entraînant souvent des conséquences néfastes pour la santé. Ces études mettent en lumière le rôle interconnecté et considérable du microbiome dans les processus physiologiques, constituant un écosystème extrêmement fragile, facilement perturbé mais difficile à rééquilibrer.

À l'avenir, la compréhension de la dynamique complexe médicament-microbiome-hôte devrait améliorer la pharmacothérapie et le bien-être des patients. En tant que professionnels de santé, la formation continue sur les découvertes scientifiques peut aider à identifier et potentiellement corriger les perturbations microbiennes induites par les médicaments. Comprendre l'effet des médicaments sur ordonnance sur le microbiome intestinal nous permettra d'optimiser leur impact positif chez les patients qui en dépendent, tout en minimisant les effets secondaires potentiels. Si vous êtes un professionnel de santé et souhaitez en savoir plus sur l'impact des mécanismes thérapeutiques sur vos patients , visitez notre boutique pour découvrir nos tests qui vous permettront de mieux comprendre la santé intestinale de vos patients. Connectez-vous à GutChat, notre chatbot IA dédié à la santé intestinale , ou contactez directement un membre de l'équipe à l' adresse info@injoy.bio pour optimiser vos soins.


Sources

  1. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fphar.2020.01153/full
  2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8295378/
  3. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0163725822002212?via%3Dihub
  4. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10051028/
  5. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0165178119303701
  6. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/mbo3.1260
  7. https://www.gastrojournal.org/article/S0016-5085(04)00461-5/fulltext


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