Comprendre la transplantation fécale : un guide complet sur la transplantation de microbiote fécal

Understanding FMT: An A to Z Guide on Fecal Microbiota Transplantation
Vous avez peut-être entendu parler de la transplantation de microbiote fécal, ou TMF. Les recherches sur cette technique se multiplient, tout comme les questions sur son utilisation. Il semble que des patients du monde entier, souffrant de diverses pathologies, se demandent comment elle fonctionne et, surtout, si elle peut leur être bénéfique. Que vous connaissiez ou non la TMF, il est utile d'aborder les aspects scientifiques qui la sous-tendent.

Les bases de la FMT

La transplantation de microbiote fécal fonctionne de manière très similaire à son nom. En résumé, un donneur sain fournit un échantillon de selles qui est transplanté dans le tube digestif d'un autre patient. Cette méthode peut améliorer la composition et la diversité du microbiote intestinal du receveur et l'aider à se rétablir d'une maladie. Un exemple d'utilisation courante et encourageante de la transplantation de microbiote fécal est le cas d'une infection récurrente à C. difficile . C. difficile est une bactérie invasive qui se reproduit volontiers dans les intestins et libère des toxines, provoquant diarrhée sévère, inflammation et fièvre. Bien que l'infection à C. difficile soit souvent traitée avec succès par des antibiotiques, il arrive que l'infection réapparaisse et que la bactérie devienne résistante aux antibiotiques, laissant les patients sans beaucoup d'options. À ce stade, la transplantation de microbiote fécal contribue à restaurer le microbiote intestinal affecté par l'infection.

Si la guérison d'une infection à C. difficile est l'une des raisons les plus courantes de recourir à la TMF, ce n'est certainement pas la première fois qu'une telle pratique est mise en œuvre. La première trace d'utilisation de matières fécales comme traitement remonte au IVe siècle en Chine, où elles étaient utilisées pour améliorer l'état de patients souffrant de diarrhée sévère.

Aujourd'hui, il existe de nombreuses autres façons d'utiliser la transplantation fécale (TMF) comme traitement, et pas seulement pour les maladies infectieuses. De l'obésité au cancer, les scientifiques pensent n'avoir qu'effleuré le potentiel de la TMF. Ce qui nous intéresse le plus, ce sont les possibilités offertes par la TMF pour les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI) et le syndrome du côlon irritable (SCI). Mais avant d'aborder les spécificités de la TMF pour les MICI et le SCI , décrivons le processus même d'une transplantation fécale. ( 1 )
 

Dépistage

Sans surprise, les donneurs et les patients receveurs sont examinés avant la transplantation fécale. Environ quatre semaines avant le don de matières fécales, les candidats donneurs sains subiront des analyses de sang et de selles afin de vérifier leur éligibilité. Le candidat idéal est âgé de 18 à 65 ans, ne présente ni maladie gastro-intestinale ni symptômes d'une telle maladie, et ne présente aucune comorbidité significative susceptible de compromettre l'efficacité de la transplantation. Il ne doit pas non plus prendre de médicaments susceptibles d'altérer la qualité de ses selles, tels que des antibiotiques et des probiotiques, au cours des trois mois précédant la transplantation fécale.


Bien qu'il n'existe pas de preuve solide d'un lien entre le donneur et l'issue de la TMF, certains éléments sont à prendre en compte lors du choix d'un donneur approprié. Par exemple, il a été suggéré que les personnes vivant ensemble , comme les conjoints ou les proches parents, pourraient être les plus compatibles pour la TMF. En effet, de nombreux facteurs de risque environnementaux sont partagés par les personnes vivant sous le même toit (alimentation, habitudes de nettoyage, etc.). Pour les conjoints, cela pourrait se traduire par une réduction du risque de transmission d'infections, et pour les proches parents, le système immunitaire pourrait moins réagir à l'introduction de microbiote provenant d'un donneur dont les selles contiennent des espèces similaires, ce qui réduit également les risques d'issue défavorable de la TMF. Cependant, il ne s'agit là que de quelques théories, et il reste à déterminer quel type de donneur est le plus adapté à chaque maladie ou à chaque issue souhaitée de la TMF. ( 1 )

 
Une représentation visuelle du processus FMT ( 1 )
 

Préparation

Une fois le donneur sélectionné, il convient de prêter attention à certains points. L'information et le soutien sont deux aspects importants pour une transplantation de moelle osseuse réussie. Les receveurs doivent être préparés et bien informés sur la procédure.

Les matières fécales du donneur sont soigneusement mélangées à une solution saline stérile. Ces matières fécales contiennent de nombreuses bactéries bénéfiques et autres micro-organismes nécessaires au rétablissement de la santé des patients. Le tout est ensuite filtré pour éliminer les grosses particules. Le filtrat restant est ensuite préparé en capsules à ingérer par voie orale ou injecté dans des seringues pour être introduit dans le tube digestif du patient.

Si le filtrat fécal n'est pas prélevé par les capsules, il est réalisé par endoscopie du tractus gastro-intestinal supérieur ou inférieur, ou par une autre méthode permettant au médecin de cibler une région du tractus à l'aide d'une sonde. Il est important que les patients évitent les antibiotiques dans les 12 à 48 heures précédant leur TMF. La préparation à l'intervention est similaire à celle d'une coloscopie : l'intestin doit être pratiquement vide afin que l'échantillon du donneur puisse s'intégrer sainement à son nouveau receveur, ce que l'on appelle la prise de greffe. Ensuite, une endoscopie peut être réalisée pour injecter le filtrat fécal au receveur. Il s'agit soit d'une coloscopie, soit d'un lavement de rétention.

Vous vous demandez peut-être si la TMF est un traitement ponctuel ou un traitement qui nécessite plusieurs doses pour être efficace, mais il n'existe pas encore de réponse définitive à cette question. Tout dépend de l'état du patient. L'équipe médicale du patient peut évaluer attentivement sa réponse à la TMF afin d'en évaluer l'efficacité et de déterminer si des doses supplémentaires amélioreraient sa réponse.

Maintenant que nous comprenons tous mieux le processus FMT, examinons comment cette approche pourrait aider les personnes atteintes de MII ou de SCI . ( 1 )
 

Transplantation de microbiote fécal pour les MICI

Il est bien connu que le microbiote des personnes atteintes de maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI) est anormal et que ce déséquilibre contribue probablement à l'activité de la maladie. Avec l'évolution des populations de micro-organismes liés à une bonne santé, de nombreuses personnes atteintes de MICI pourraient certainement bénéficier d'un microbiote intestinal plus sain. L'étude de la TMF chez les patients atteints de MICI constitue donc une approche particulièrement intéressante. Son utilisation a débuté vers 2012 et, depuis, plusieurs études ont évalué son efficacité.

Pour la rectocolite hémorragique (RCH), la TMF a été utilisée dans de nombreux essais cliniques. Quatre essais menés entre 2015 et 2019 ont démontré que, chez les patients atteints de RCH depuis moins d'un an, la TMF pouvait induire une rémission, objectif recherché par tous les patients atteints de MICI. Une autre étude a évalué la capacité à maintenir une rémission clinique (absence quasi totale de symptômes au fil du temps). De nombreux patients atteints de RCH (87 %) en rémission ont maintenu leur rémission lors d'une réévaluation 48 semaines après leur TMF, tandis que parmi ceux ayant reçu le placebo dans cet essai, seulement 67 % environ ont maintenu leur rémission clinique ( 2 ). Bien que ces résultats soient encourageants, les chercheurs doivent poursuivre leurs recherches pour étudier plus en détail l'efficacité de cette approche chez les patients présentant une activité de la maladie (c'est-à-dire non en rémission), chez les patients atteints de RCH de longue durée, chez ceux souffrant d'autres pathologies, etc. Parallèlement, d'autres études ont souligné l'absence de bénéfice de la TMF dans le traitement de la RCH. Par exemple, des personnes présentant une activité de RCH légère ou modérée ont été testées pour évaluer l'efficacité de la TMF, et aucune différence notable n'a été observée entre la TMF et un traitement témoin, ce qui indique que dans ce cas, la TMF n'a pas eu d'effet positif suffisant ( 3 ). Le degré d'amélioration observé après la TMF dépend probablement de la composition des selles du donneur, de la précocité du traitement de la RCH et de l'utilisation ou non de plusieurs TMF ( 4 ). Compte tenu de ces résultats différents, il reste encore beaucoup à faire concernant la TMF chez les patients atteints de RCH, mais il est très encourageant de constater qu'elle a déjà aidé des personnes.

Concernant la maladie de Crohn (MC), les résultats concernant l'efficacité de la TMF sont également mitigés. Un résultat intéressant, issu d'une étude qui n'a démontré aucun bénéfice significatif de la TMF pour soulager l'activité de la maladie chez les patients atteints de MC, a en réalité montré qu'elle entraînait une amélioration de la qualité de vie liée à la santé chez ces participants grâce à une meilleure prise en charge de la maladie et à une meilleure attitude envers la TMF après l'avoir essayée. La qualité de vie étant (sans surprise) un aspect crucial du bien-être des patients atteints de MC, ce résultat peut néanmoins être considéré comme notable ( 5 ). De plus, de nombreux rapports de cas portent sur un petit échantillon de patients atteints de MC et ont constaté une amélioration significative de leurs symptômes grâce à la TMF. Par exemple, un cas de MC sévère et réfractaire (ne répondant pas au traitement) a été traité avec succès par TMF, ce qui a suscité un intérêt croissant au sein de la communauté scientifique pour étudier comment le remodelage du microbiote intestinal pourrait être utilisé pour guérir les personnes atteintes de la maladie (6 ). Dans une étude plus vaste, 30 patients atteints de MC réfractaire ont été testés et les chercheurs ont obtenu des résultats intéressants. Après une seule séance de TMF, les patients présentaient en moyenne un poids santé plus élevé, et le traitement a eu un effet significatif, rapide et continu, sur le soulagement des douleurs abdominales persistantes associées à la MC persistante ( 7 ). Il s'agit d'un exemple encourageant du potentiel de la TMF comme traitement sûr et pratique pour soulager efficacement les patients atteints de MC réfractaire. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour valider cette approche en milieu clinique.

Vous vous demandez peut-être si ce traitement pourrait être utilisé chez les enfants. Des études ont été menées sur l'utilisation de la greffe de moelle osseuse (FMT) dans le traitement des maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI) pédiatriques. Lors d'une étude de 2016, neuf jeunes patients présentant des symptômes légers à modérés de la MC et ayant reçu une FMT par voie digestive haute ont vu leur maladie s'améliorer et sept des neuf participants ont obtenu une rémission dans les deux semaines suivant le traitement. La FMT a été jugée infructueuse chez les patients n'ayant pas pris la greffe (ce qui signifie que la greffe n'a pas été tout à fait réussie) ou dont le microbiote était plus proche de celui du donneur, auquel cas l'amélioration de la maladie a été faible, voire nulle ( 8 ). Ce cas illustre le potentiel de la FMT dans le traitement de la MICI pédiatrique et contribue à une discussion plus large sur l'influence de la composition du microbiote intestinal du donneur sur l'évolution de la maladie chez le receveur.

En général, bien que la TMF soit reconnue comme une option sûre et fiable pour les infections à C. difficile , les données probantes concernant les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI) continuent d'évoluer, et des effets secondaires plus importants ont été rapportés chez ces patients après TMF que chez les patients atteints de C. difficile . En effet, le traitement de l'infection à C. difficile par TMF chez les patients atteints d'une MICI sous-jacente a été étudié, et il semble que la présence d'une MICI contribue à davantage d'effets secondaires. Les recherches suggèrent généralement que la TMF est plus susceptible d'entraîner des effets secondaires pour traiter les MICI que pour les infections à C. difficile , bien que ces effets secondaires soient généralement légers ou modérés, comme de la fièvre. ( 9 )
 

Transplantation de microbiote fécal pour le syndrome du côlon irritable

Tout comme pour les MICI, les preuves de l'efficacité de la TMF chez les personnes atteintes du syndrome du côlon irritable (SCI) continuent de s'accumuler. Un résultat intrigant de 2019 a démontré l'efficacité de la TMF contre le SCI. Des tests ont été réalisés auprès de 165 personnes atteintes du SCI, randomisées pour recevoir un placebo (qui, si vous vous posez la question, était une transplantation fécale de leurs propres selles), une faible dose de TMF ou une dose plus élevée de TMF ; toutes les selles utilisées pour préparer le traitement provenaient du même donneur sain. Trois mois après le traitement, une amélioration significative des symptômes du SCI a été observée chez 24 % des patients ayant reçu le placebo, 77 % de ceux ayant reçu la TMF à faible dose et 89 % de ceux ayant reçu la TMF à forte dose. De plus, une amélioration significative de la qualité de vie et une diminution de la fatigue ont été observées chez les patients ayant reçu la TMF. Si l'on ajoute à cela le fait que ces receveurs ont également présenté des changements majeurs dans leurs profils de microbiote intestinal (composition, stabilité, diversité), il est certainement important de s'assurer que le prélèvement se fait auprès d'un donneur sain présentant un microbiote intestinal souhaitable et que des doses plus élevées sont utilisées ( 10 ). Dans le cadre du suivi de cette étude, les chercheurs ont examiné l'impact de la TMF sur le SCI après un an et ont constaté que la plupart des participants présentaient encore une réponse positive à ce stade, notamment un meilleur soulagement des symptômes et une meilleure qualité de vie. De plus, les profils de microbiote intestinal des patients se sont encore améliorés par rapport à trois mois plus tard ( 11 ).

 

Réflexions d'adieu

Il s'agit certes d'un domaine de recherche en cours, mais les premiers signes d'efficacité de la TMF pour ces affections sont encourageants. De nombreux facteurs doivent être pris en compte pour expliquer l'échec de certaines recherches tandis que d'autres donnent des résultats positifs. L'origine des selles du donneur, le dosage des selles, la fréquence des dosages, la nature de la maladie du receveur, son protocole médicamenteux et bien d'autres facteurs peuvent influencer les résultats des essais. Par exemple, la TMF sera reçue différemment par un patient ayant pris des antibiotiques avant la TMF. Par conséquent, il n'existe pas de réponse claire quant à savoir si la TMF, en tant que traitement autonome, peut soulager des maladies chroniques telles que les MICI ou le SCI. Un autre problème concernant la TMF est le manque de disponibilité et de réglementation dans différents pays, ce qui pousse de nombreuses personnes à se faire soigner elles-mêmes. Cependant, il est important de garder à l'esprit qu'il ne s'agit pas d'une procédure anodine ; il est donc toujours recommandé de consulter un professionnel de santé. En attendant que de nouvelles recherches élargissent la disponibilité de la TMF, continuez à interroger vos médecins sur cette approche. Il est toujours utile de se renseigner sur les options thérapeutiques et sur la position de la médecine sur ces approches !


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Sources

  1. https://www.clinicalkey.com/#!/content/playContent/1-s2.0-S0929664618305552?returnurl=https:%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0929664618305552%3Fshowall%3Dtrue&referrer=https:%2F%2Fpubmed.ncbi.nlm.nih.gov%2F
  2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30873549/
  3. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7530266/#B43
  4. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5479396/
  5. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26146498/
  6. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3819561/
  7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25168749/
  8. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4329080/
  9. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5479396/
  10. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31852769/
  11. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nmo.14200
 
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