C'est l'une des questions que nous recevons quotidiennement, notamment lors de nos forums « Ask Me Anything » sur Reddit . Alors, mettons les choses au clair : quel est l'effet des antibiotiques sur le microbiome intestinal ? Avant d'entrer dans les détails des recherches actuelles dans ce domaine, abordons le développement du microbiome intestinal humain. Chaque microbiome est unique en raison de la multitude de facteurs qui le composent. Tout commence dans l'utérus : l'interaction entre le fœtus et le monde extérieur passe par la mère, dont l'alimentation et l'environnement extérieur peuvent influencer le développement du microbiome du bébé. Ensuite, le mode d'accouchement, le mode d'alimentation, l'utilisation d'antibiotiques, l'apport en nutriments et l'environnement après la naissance contribuent tous au développement du microbiome. Les premières semaines de la vie d'un nouveau-né sont extrêmement importantes, et après la petite enfance, le microbiome d'un individu est pratiquement établi pour la vie. ( 1 , 2 )
Mais nous allons trop vite. Vous connaissez probablement le terme « antibiotique » et avez une idée générale de son action, probablement parce que vous avez dû en prendre vous-même. Rien qu'en 2014, aux États-Unis, les CDC ont signalé que plus de 266 millions d'ordonnances d'antibiotiques avaient été délivrées en pharmacie ( 3 ). Avec autant de personnes se voyant prescrire des antibiotiques, et jusqu'à un tiers des prescriptions étant considérées comme totalement inutiles, les conséquences sont nombreuses. La liste des problèmes liés à l'utilisation et à la mauvaise utilisation des antibiotiques est longue, incluant des enjeux mondiaux comme la résistance aux antimicrobiens et l'impact environnemental négatif, mais un effet qui a suscité beaucoup d'attention au sein de la communauté de la santé intestinale est l'impact des antibiotiques sur le microbiome intestinal.
Vous vous demandez peut-être comment cela a pu se produire. Les antibiotiques combattent les infections ; ils sont censés combattre indistinctement les bactéries, qu'elles soient bénéfiques ou nocives pour l'intestin et l'être humain qui les héberge. Cela peut être problématique, car les problèmes de santé intestinale sont largement liés à un dysfonctionnement du microbiome intestinal dû à des déséquilibres dans les populations microbiennes présentes (en termes de diversité, de types de microbes présents et de quantités relatives de ces espèces). ( 4 )
Compte tenu de ces effets sur la santé intestinale, les antibiotiques peuvent déclencher des diarrhées et d'autres symptômes gastro-intestinaux. Dans certains cas, comme lors de l'utilisation d'antibiotiques pour traiter une infection grave comme l'infection à C. difficile , les bactéries intestinales peuvent devenir résistantes aux médicaments, provoquant une infection récurrente à C. difficile résistante aux antibiotiques ( 5 ). L'antibiorésistance est un problème de santé mondial qui mérite une attention particulière, car ses dangers vont bien au-delà de la santé intestinale.
Bien que les antibiotiques soient souvent prescrits de manière excessive par les cliniciens, contribuant ainsi au problème de la résistance aux antibiotiques , leur utilisation est parfois nécessaire et inévitable. N'ayez pas peur de prendre une ordonnance, mais assurez-vous d'avoir demandé à votre pharmacien comment prendre les antibiotiques en toute sécurité et pourquoi ils sont importants pour votre santé à ce moment-là. Si tout le monde ne ressent pas les effets d'un traitement antibiotique sur son intestin, c'est un phénomène suffisamment fréquent pour que l'on se demande ce qui pourrait arriver à son microbiome et comment le restaurer.
Bien que les effets indésirables ne soient généralement pas liés à l'utilisation d'antibiotiques, les effets immédiats et à long terme sur la santé du microbiome sont avérés. La recherche ne se limite pas à discuter des risques de résistance et des modifications de la diversité et de la composition des microbes. Les antibiotiques pouvant affecter tous les types de bactéries, y compris celles qui produisent des vitamines , contribuent au métabolisme et contrôlent la réponse immunitaire, toutes ces caractéristiques peuvent être affectées. Ainsi, une carence en certaines vitamines comme la vitamine B12 et la vitamine K2, des troubles digestifs et le déclenchement de réponses immunitaires inappropriées ou inutiles peuvent survenir suite à l'utilisation d'antibiotiques ( 6 ). Concernant les maladies, la recherche a établi un lien entre la prise d'antibiotiques et le développement de nombreux problèmes actuellement en augmentation dans de nombreuses régions du monde, tels que l'obésité, la prise de poids, les infections gastro-intestinales, les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin et le cancer colorectal, sans parler du risque de favoriser la résistance aux antibiotiques (7 ). Être exposé aux antibiotiques tôt dans la vie est courant, mais recevoir ces traitements pendant l'enfance ne vous dispense pas de ces impacts potentiels plus tard dans la vie. En fait, les nourrissons ayant reçu des antibiotiques entre 6 et 12 mois ont montré des retards significatifs dans le développement de leur microbiote à l'âge de deux ans ( 8 ). Sachant que la petite enfance est essentielle au profil microbien d'un individu tout au long de sa vie, ce retard de développement et les modifications associées de la diversité bactérienne constituent un problème majeur.
Il est important de noter que la prise d'antibiotiques à un si jeune âge entraîne un déséquilibre du microbiome susceptible de favoriser le développement de maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI). Bien que l'environnement, la génétique et d'autres facteurs puissent contribuer à l'apparition de MICI, le fait que des études aient établi un lien avec l'utilisation précoce d'antibiotiques et l'exposition répétée à ces traitements durant l'enfance met véritablement en lumière le rôle du microbiome dans cette maladie.
On comprend donc que le microbiome, surtout pendant son développement, est sensible aux effets de l'exposition aux antibiotiques. Mais cela n'aide pas vraiment les personnes ayant déjà suivi ces traitements.
Dans ce contexte, comment restaurer réellement votre microbiote intestinal si vous vous sentez affecté par la prise d'antibiotiques ? En bref, la science est encore en pleine évolution sur ce sujet et il n'existe pas de solution miracle pour résoudre vos problèmes gastro-intestinaux. Cependant, plusieurs éléments sont connus pour favoriser la croissance, le développement et la colonisation des bactéries intestinales. Cela peut aider votre microbiote à mieux fonctionner en harmonie avec le reste de votre organisme, évitant ainsi les effets indésirables des antibiotiques. ( 9 )
Bien que l'utilisation de probiotiques , de transplantations de microbiote fécal , de phagothérapie et d'autres interventions fasse l'objet de nombreuses discussions, les recherches et l'accessibilité de ces options sont insuffisantes pour que nous puissions les soutenir avec confiance à l'heure actuelle. Heureusement, il existe des moyens d'agir pour aider votre microbiome à se reconstruire et à prospérer. Voici quelques conseils pour soigner votre microbiome et vous-même ( 10 ) :
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Essayez le régime méditerranéen. Sa variété d'aliments riches en fibres, vitamines, minéraux, acides gras oméga-3 et autres nutriments nourrit vos bactéries intestinales, les aidant à survivre et à produire les sous-produits nécessaires à une digestion saine.
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Intégrez des aliments et boissons fermentés, comme la choucroute et le kéfir, à votre alimentation. Les produits fermentés contiennent des bactéries bénéfiques qui contribuent à restaurer le microbiote intestinal.
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Assurez-vous de réduire le stress au minimum, car cela affecte négativement le microbiome intestinal et la santé mentale, qui sont également liés.
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L'exercice et le sommeil sont bons pour tous les aspects de votre santé, y compris votre microbiome intestinal, alors assurez-vous de rester actif et de vous reposer suffisamment !
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Réduisez votre consommation de sucre et d’édulcorants artificiels , car ces produits peuvent augmenter l’inflammation ou entraîner un déséquilibre supplémentaire du microbiome intestinal.
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Sources
